Struktura aminokyselin, peptidů a bílkovin.
|
|
- Olga Veselá
- před 5 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 Struktura aminokyselin, peptidů a bílkovin. Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 2.LF UK a FN Motol MUDr. Bc. Matej Kohutiar, Ph.D. matej.kohutiar@lfmotol.cuni.cz Praha 2018
2 I. Struktura aminokyselin a peptidů
3 Aminokyseliny Substituční deriváty karboxylových kyselin H α R Poloha aminoskupiny + H 3 N γ NH 3 + GABA - β NH β-alanin
4 Aminokyseliny Prolin je sekundární amin H N H 20 kódovaných aminokyselin a stovky nekódovaných
5 Stereochemie aminokyselin zrcadlo
6 Stereochemie aminokyselin zrcadlo objekt, který nemá střed a rovinu symetrie je chirální
7 Stereochemie aminokyselin zrcadlo objekt, který nemá střed a rovinu symetrie je chirální asymetrický uhlík = uhlík se 4 různými substituenty
8 Stereochemie aminokyselin Fischerova projekce CH H H 2 N CH H R D-aminokyselina Absolutní konfigurace R L-aminokyselina CH CH H H 2 N H R (R)-aminokyselina R (S)-aminokyselina
9 Klasifikace aminokyselin ALIFATICKÉ NEPLÁRNÍ ARMATICKÉ AMINKYSELINY NENABITÉ PLÁRNÍ KYSELÉ ZÁSADITÉ
10 ALIFATICKÉ NEPLÁRNÍ ARMATICKÉ AMINKYSELINY NENABITÉ PLÁRNÍ KYSELÉ H CH 3 H H N H S CH3 ZÁSADITÉ H CH 3 H H CH 3 CH 3 CH 3 CH3 CH 3
11 ALIFATICKÉ NEPLÁRNÍ ARMATICKÉ AMINKYSELINY NENABITÉ PLÁRNÍ KYSELÉ ZÁSADITÉ H H N H
12 ALIFATICKÉ NEPLÁRNÍ ARMATICKÉ AMINKYSELINY NENABITÉ PLÁRNÍ KYSELÉ ZÁSADITÉ H H H CH 3 H H H SH H H H H
13 ALIFATICKÉ NEPLÁRNÍ ARMATICKÉ AMINKYSELINY NENABITÉ PLÁRNÍ KYSELÉ ZÁSADITÉ H H H H
14 ALIFATICKÉ NEPLÁRNÍ ARMATICKÉ AMINKYSELINY NENABITÉ PLÁRNÍ KYSELÉ H H N ZÁSADITÉ N H H NH NH
15 Klasifikace aminokyselin Esenciální Podmíněné esenciální Neesenciální Totálně C skelet je esenciální Vznik z esenciálních AMK Zdroje bílkovin rostlinné a živočišné Kvalita bílkovin plnohodnotné neplnohodnotné Deficit u zátěže Syntéza je dostatečná LYS VAL CYS ARG ALA THR LEU TYR CYS GLY ILE RN TYR GLU TRP RN ASP PHE GLU PR MET HIS ASN
16 Hydrofobicita ΔS >0 Cytochrom c RNAasa Lysosym Chymotrypsin Směr růstu hydrofobicity molekuly (žlutě)
17 Hydrofobicita ΔS >0 červená modrá + bílá 0 Kyte, J. and Doolittle, R A simple method for displaying the hydropathic character of a protein. J. Mol. Biol. 157:
18 Acidobazické vlastnosti aminokyselin - + H 3 N H R Zwitterion Amfion bojetný ion Počet nábojů = Σ nábojů (bez ohledu na znaménko Volný náboj = Σ nábojů Isoelektrický bod pi = nulový volný náboj
19 Acidobazické vlastnosti aminokyselin Při ph > pi se molekula chová jako kyselina a stává se donorem H H 3 N H H 2 N H + H + R R Při ph < pi se molekula chová jako zásada a stává se akceptorem H + - H + H 3 N H + H + N R H 3 + H R
20 Acidobazické vlastnosti aminokyselin H H 3 N CH 2 pka 1 pka 2 + H 3 N CH 2 H 2 N CH pi pk a1 2 pk a2 ph pk a log Gly Gly 0
21 ph Acidobazické vlastnosti aminokyselin + H 3 N CH 2 H ph< pi + H 3 N CH 2 - ph>pi H 2 N CH ,0 10,0 pt 2 8,0 6,0 pt 1 4,0 2,0 0,0 0,0 20,0 40,0 60,0 80,0 NaH (ml) 100,0 120,0 140,0 160,0
22 ph Acidobazické vlastnosti aminokyselin + H 3 N CH 2 H ph< pi + H 3 N CH 2 - ph>pi H 2 N CH ,0 10,0 pt 2 8,0 6,0 pt 1 4,0 2,0 Gly + /Gly 0 Gly 0 Gly 0 /Gly 0,0 0,0 20,0 40,0 60,0 80,0 NaH (ml) 100,0 120,0 140,0 160,0
23 ph Acidobazické vlastnosti aminokyselin + H 3 N CH 2 H ph< pi + H 3 N CH 2 - ph>pi H 2 N CH ,0 10,0 pt 2 8,0 6,0 4,0 2,0 pt 1 0 Gly ph pka log Gly Gly + /Gly 0 Gly 0 Gly 0 /Gly 0,0 0,0 20,0 40,0 60,0 80,0 NaH (ml) 100,0 120,0 140,0 160,0
24 ph Acidobazické vlastnosti aminokyselin + H 3 N CH 2 H ph< pi + H 3 N CH 2 - ph>pi H 2 N CH ,0 10,0 pt 2 8,0 6,0 pt 1 4,0 pka 1 2,0 Gly + /Gly 0 Gly 0 Gly 0 /Gly 0,0 0,0 20,0 40,0 60,0 80,0 NaH (ml) 100,0 120,0 140,0 160,0
25 ph Acidobazické vlastnosti aminokyselin + H 3 N CH 2 H ph< pi + H 3 N CH 2 - ph>pi H 2 N CH ,0 10,0 8,0 pka 2 pt 2 6,0 pt 1 4,0 pka 1 2,0 Gly + /Gly 0 Gly 0 Gly 0 /Gly 0,0 0,0 20,0 40,0 60,0 80,0 NaH (ml) 100,0 120,0 140,0 160,0
26 Acidobazické vlastnosti aminokyselin Skupina Aminokyselina pk a volné pk a v proteinu α-karboxyl Všechny 1,7-2,6 1,8-3,6 β-karboxyl Asp 3,86 3,0-4,7 Imidazol His 6,04 5,6-7,0 α-amin Všechny 8,8-10,7 7,9-10,6 ε-amin Lys 10,53 9,4-11,0 fenol Tyr 10,07 9,8-10,8 thiol Cys 8,33 8,3-8,6
27 Acidobazické vlastnosti aminokyselin V jaké formě se bude vyskytovat kyselina glutamová při ph=7,4? α-karboxyl H α γ H γ-karboxyl α-aminoskupina
28 Acidobazické vlastnosti aminokyselin V jaké formě se bude vyskytovat kyselina glutamová při ph=7,4? α-karboxyl pk a1 = 2,0 H α γ H γ-karboxyl pk a2 = 3,8 α-aminoskupina pk a3 = 9,1
29 Acidobazické vlastnosti aminokyselin V jaké formě se bude vyskytovat kyselina glutamová při ph=7,4? - Struktura odpovídá zwitterionu = nulový volný náboj α NH 3 + γ H Funkční skupina pk a <2,0 2,0 3,8 3,8 9,1 9,1< α-karboxyl 2, γ-karboxyl 3, α-amin 9, Volný náboj
30 Chemické reakce aminokyselin Vznik peptidové vazby NH 3 + H + H 3 N H H 3 C CH 3 Valin H 3 N CH 3 - Threonin H H H 3 C NH CH 3 Valyl-threonin CH 3 - C H 3 N C C H R detaily v přednášce metabolizmus aminokyselin I a II
31 Chemické reakce aminokyselin Redoxní rovnováha cysteinu H H H H SH + HS S S Cystein Cystein Cystin Redukovaná forma Cys xidovaná forma Cys
32 Peptidy Peptidy (2+) ligopeptidy (2 10) Polypeptidy (10+) Proteiny (100+) H 3 C N-konec + H 3 N CH 3 NH H Valyl-threonin CH 3 - C-konec γ-glutamyl-cysteinyl-glycin GLUTATHIN
33 II. Struktura proteinů
34 Proteiny protein=bílkovina funkční skupiny (slabé kyseliny/zásady) stálé vnitřní prostředí velikost v Da zdroj dusíku brovská variabilita
35 Proteiny Kolik dipeptidů lze teoreticky poskládat z 20 základních proteinogenních aminokyselin, pokud lze každou aminokyselinou použít jenom jednou? záleží na pořadí variace bez opakování V n! (n - k)! 20! (20 2)! 20! 18! ! 18! 380
36 Proteiny Kolik dipeptidů lze teoreticky poskládat z 20 základních proteinogenních aminokyselin, pokud se mohou opakovat? záleží na pořadí variace s opakováním V n k
37 Proteiny Kolik hektapeptidů (100) lze teoreticky poskládat z 20 základních proteinogenních aminokyselin, pokud se mohou opakovat? záleží na pořadí variace s opakováním V n k , počet odhadovaných atomů ve vesmíru ~10 90
38 Proteiny Klasifikace: 1. Podle funkce 2. Podle složení 3. Podle tvaru
39 Proteiny 1. Podle funkce Enzymy Zásobní bílkoviny Transportní Kontraktilní Hormony brana Strukturální Receptory pro signální molekuly 2. Podle složení 3. Podle tvaru
40 Proteiny 1. Podle funkce 2. Podle složení Glykoproteiny Metaloproteiny Lipoproteiny 3. Podle tvaru
41 Proteiny 1. Podle funkce 2. Podle složení 3. Podle tvaru Globulární Fibrilární Membránové
42 Struktura proteinů Nativní konformace = biologicky aktivní Primární struktura Sekundární struktura Terciární struktura Kvarterní struktura Molecular chaperones in protein folding and proteostasis - Scientific Figure on ResearchGate. Available from: shaped_fig3_ [accessed 28 Sep, 2018]
43 Peptidová vazba a primární struktura Resonanční struktury peptidové vazby
44 Peptidová vazba a primární struktura trans cis
45 Peptidová vazba a primární struktura Torzní úhly Cα-N-C (Φ) a Cα-C-N (ψ)
46 Peptidová vazba a primární struktura Ramachandranův diagram mezení rotace
47 Sekundární struktura NH CHR C α-helix Parametry helixu: výška závitu (0,54 nm) směr otáčení (+,-) počet aminokyselin (3,6) NE: Pro, Hypro, přítomnost aminokyselin se stejným nábojem
48 Sekundární struktura β-skládaný list Paralelní Antiparalelní β-barel
49 Sekundární struktura Suprasekundární struktury (motivy) αβα, αα, βαβ, β-barel β-barel Zinkový prst EF hand motif Leucinový zip
50 Terciární struktura Prostorové uspořádaní polypeptidového řetězce, Doménové uspořádání Interakce postranních řetězců a disulfidické můstky
51 Kvarterní struktura Více samostatných polypeptidových řetězců (pojdednotek) organizovaných do celku Dimery, trimery, tetramery Homodimer, heterodimer Nekovaleltní interakce
52 Interakce stabilizující molekuly bílkovin 1. Vazba vodíkovým můstkem 3. Londonovy disperzní síly 2. Elektrostatické interakce 4.Patrové interakce 5.Hydrofobní interakce ΔS >0
53 Folding (sbalování proteinů)
54 Folding (sbalování proteinů) Hydrofobní efekt TΔS>0 Stabilita proteinu ΔG<0 Vodíkové vazby ΔH<0 Nevazebné interakce ΔH<0 Konformační změny řetězce TΔS<0
55 Patologické konformace proteinů Globulární protein fibrila protofibrila Nesvinutý protein Nerozpustné extracelulární útvary s převahou β-struktury zralé fibrily
56 Patologické konformace proteinů Globulární protein fibrila protofibrila Nesvinutý protein Depozita amyloidu v mozku pacienta s AD (kongo červeň) zralé fibrily
57 Denaturace Ztráta charakteristické nativní struktury vedoucí ke ztrátě biologických funkcí Neuspořádané klubko (random coil) Expozice hydrofobních skupin a řetězců Denaturace: vratná nevratná Teplota
Struktura proteinů. - testík na procvičení. Vladimíra Kvasnicová
Struktura proteinů - testík na procvičení Vladimíra Kvasnicová Mezi proteinogenní aminokyseliny patří a) kyselina asparagová b) kyselina glutarová c) kyselina acetoctová d) kyselina glutamová Mezi proteinogenní
VíceBílkoviny - proteiny
Bílkoviny - proteiny Proteiny jsou složeny z 20 kódovaných aminokyselin L-enantiomery Chemická struktura aminokyselin R představuje jeden z 20 různých typů postranních řetězců R Hlavní řetězec je neměnný
VícePROTEINY. Biochemický ústav LF MU (H.P.)
PROTEINY Biochemický ústav LF MU 2013 - (H.P.) 1 proteiny peptidy aminokyseliny 2 Aminokyseliny 3 Charakteristika základní stavební jednotky proteinů geneticky kódované 20 základních aminokyselin 4 a-aminokyselina
VíceGymnázium Vysoké Mýto nám. Vaňorného 163, 566 01 Vysoké Mýto
Gymnázium Vysoké Mýto nám. Vaňorného 163, 566 01 Vysoké Mýto SUBSTITUČNÍ DERIVÁTY KARBOXYLOVÝCH O KYSELIN R C O X karboxylových kyselin - substituce na vedlejším uhlovodíkovém řetězci aminokyseliny - hydroxykyseliny
VíceBílkoviny. Charakteristika a význam Aminokyseliny Peptidy Struktura bílkovin Významné bílkoviny
Bílkoviny harakteristika a význam Aminokyseliny Peptidy Struktura bílkovin Významné bílkoviny 1) harakteristika a význam Makromolekulární látky složené z velkého počtu aminokyselinových zbytků V tkáních
VíceAminokyseliny. Gymnázium a Jazyková škola s právem státní jazykové zkoušky Zlín. Tematická oblast Datum vytvoření Ročník Stručný obsah Způsob využití
Aminokyseliny Tematická oblast Datum vytvoření Ročník Stručný obsah Způsob využití Autor Kód Chemie přírodních látek proteiny 18.7.2012 3. ročník čtyřletého G Určování postranních řetězců aminokyselin
VíceNázvosloví cukrů, tuků, bílkovin
Názvosloví cukrů, tuků, bílkovin SACARIDY CUKRY MNSACARIDY LIGSACARIDY PLYSACARIDY (z mnoha molekul monosacharidů) ALDSY KETSY -DISACARIDY - TRISACARIDY - TETRASACARIDY atd. -aldotriosy -aldotetrosy -aldopentosy
VíceTestové úlohy aminokyseliny, proteiny. post test
Testové úlohy aminokyseliny, proteiny post test 1. Které aminokyseliny byste hledali na povrchu proteinů umístěných uvnitř fosfolipidových membrán a které na povrchu proteinů vyskytujících se ve vodném
VícePřírodní polymery proteiny
Přírodní polymery proteiny Funkční úloha bílkovin 1. Funkce dynamická transport kontrola metabolismu interakce (komunikace, kontrakce) katalýza chemických přeměn 2. Funkce strukturální architektura orgánů
VíceMetabolismus bílkovin. Václav Pelouch
ZÁKLADY OBECNÉ A KLINICKÉ BIOCHEMIE 2004 Metabolismus bílkovin Václav Pelouch kapitola ve skriptech - 3.2 Výživa Vyvážená strava člověka musí obsahovat: cukry (50 55 %) tuky (30 %) bílkoviny (15 20 %)
VíceVýukový materiál zpracován v rámci projektu EU peníze školám Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/34.0996
Výukový materiál zpracován v rámci projektu EU peníze školám Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/34.0996 Šablona: III/2 č. materiálu: VY_32_INOVACE_CHE_413 Jméno autora: Mgr. Alena Krejčíková Třída/ročník:
VíceÚVOD DO BIOCHEMIE. Dělení : 1)Popisná = složení org., struktura a vlastnosti látek 2)Dynamická = energetické změny
BIOCHEMIE 1 ÚVOD DO BIOCHEMIE BCH zabývá se chemickými procesy v organismu a chemickým složením živých organismů Biologie: bios = život + logos = nauka Biochemie: bios = život + chemie Dělení : Chemie
VíceAMINOKYSELINY Substituční deriváty karboxylových kyselin ( -COOH, -NH 2 nebo -NH-) Prolin α-iminokyselina
Aminokyseliny - Základní stavební jednotky peptidů a proteinů - Proteinogenní (kódované) 20 AK - Odvozené chemické modifikace, metabolity - Esenciální AK AMINOKYSELINY Substituční deriváty karboxylových
VíceAminokyseliny, peptidy a bílkoviny
Aminokyseliny, peptidy a bílkoviny Dělení aminokyselin Z hlediska obsahu v živé hmotě Z hlediska významu ve výživě Z chemického hlediska Z hlediska rozpustnosti Dělení aminokyselin Z hlediska obsahu v
VíceAminokyseliny příručka pro učitele. Obecné informace: Téma otevírá kapitolu Bílkoviny, která svým rozsahem překračuje rámec jedné vyučovací hodiny.
Obecné informace: Aminokyseliny příručka pro učitele Téma otevírá kapitolu Bílkoviny, která svým rozsahem překračuje rámec jedné vyučovací hodiny. Navazující učivo Před probráním tématu Aminokyseliny probereme
VíceInovace studia molekulární a buněčné biologie
Inovace studia molekulární a buněčné biologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. MBIO1/Molekulární biologie 1 Tento projekt je spolufinancován
VíceObecná struktura a-aminokyselin
AMINOKYSELINY Obsah Obecná struktura Názvosloví, třídění a charakterizace Nestandardní aminokyseliny Reaktivita - peptidová vazba Biogenní aminy Funkce aminokyselin Acidobazické vlastnosti Optická aktivita
VíceMOLEKULOVÉ MODELOVÁNÍ - STRUKTURA. Monika Pěntáková Katedra Farmaceutické chemie
MOLEKULOVÉ MODELOVÁNÍ - STRUKTURA Monika Pěntáková Katedra Farmaceutické chemie Chemická struktura a geometrie KONFORMACE = můžeme změnit pouhým otočením kolem kovalentní vazby KONFIGURACE = při změně
VíceAminokyseliny. Peptidy. Proteiny.
Aminokyseliny. Peptidy. Proteiny. Struktura a vlastnosti aminokyselin 1. Zakreslete obecný vzorec -aminokyseliny. Která z kodovaných aminokyselin se z tohoto vzorce vymyká? 2. Které aminokyseliny mají
VíceBiochemie I. Aminokyseliny a peptidy
Biochemie I Aminokyseliny a peptidy AMINOKYSELINY Když se řekne AK ( -COOH, -NH 2 nebo -NH-) prostorový vztah aminoskupiny a karboxylové skupiny: - (=2-), -(=3-)... -(= poslední) -alanin součástí koenzymu
VíceMolekulární biofyzika
Molekulární biofyzika Molekuly v živých systémech - polymery Lipidy (mastné kyseliny, fosfolipidy, isoprenoidy, sfingolipidy ) proteiny (aminokyseliny) nukleové kyseliny (nukleotidy) polysacharidy (monosacharidy)
VíceAminokyseliny, struktura a vlastnosti bílkovin. doc. Jana Novotná 2 LF UK Ústav lékařské chemie a klinické biochemie
Aminokyseliny, struktura a vlastnosti bílkovin doc. Jana Novotná 2 LF UK Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 1. 20 aminokyselin, kódovány standardním genetickým kódem, proteinogenní, stavebními
VíceI N V E S T I C E D O R O Z V O J E V Z D Ě L Á V Á N Í
I V E S T I E D Z V J E V Z D Ě L Á V Á Í AMIKYSELIY PEPTIDY AMIKYSELIY = substituční/funkční deriváty karboxylových kyselin = základní jednotky proteinů (α-aminokyseliny) becný vzorec 2-aminokyselin (α-aminokyselin):
VíceProteiny Genová exprese. 2013 Doc. MVDr. Eva Bártová, Ph.D.
Proteiny Genová exprese 2013 Doc. MVDr. Eva Bártová, Ph.D. Bílkoviny (proteiny), 15% 1g = 17 kj Monomer = aminokyseliny aminová skupina karboxylová skupina α -uhlík postranní řetězec Znát obecný vzorec
Víceaminokyseliny a proteiny
aminokyseliny a proteiny funkce proteinů : proteiny zastávají téměř všechny biologické funkce, s výjimkou přenosu informace stavební funkce buněk a tkání biokatalyzátory-urychlují biochemické reakce -
VíceAMINOKYSELINY Substituční deriváty karboxylových kyselin ( -COOH, -NH 2 nebo -NH-) Prolin α-iminokyselina
Aminokyseliny - Základní stavební jednotky peptidů a proteinů - Proteinogenní (kódované) 20 AK - Odvozené chemické modifikace, metabolity - Esenciální AK AMINOKYSELINY Substituční deriváty karboxylových
VíceMetabolizmus aminokyselin II
Metabolizmus aminokyselin II Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 2.LF UK a FN Motol MUDr. Bc. Matej Kohutiar, Ph.D. matej.kohutiar@lfmotol.cuni.cz Praha 2018 Degradace uhlíkové kostry aminokyselin
VíceBÍLKOVINY. V organismu se nedají nahradit jinými sloučeninami, jen jako zdroj energie je mohou nahradit sacharidy a lipidy.
BÍLKOVINY o makromolekulární látky, z velkého počtu AMK zbytků o základ všech organismů o rostliny je vytvářejí z anorganických sloučenin (dusičnanů) o živočichové je musejí přijímat v potravě, v trávicím
VíceMetabolismus aminokyselin. Vladimíra Kvasnicová
Metabolismus aminokyselin Vladimíra Kvasnicová Aminokyseliny aminokyseliny přijímáme v potravě ve formě proteinů: důležitá forma organicky vázaného dusíku, který tak může být v těle využit k syntéze dalších
VíceVzdělávací materiál. vytvořený v projektu OP VK. Anotace. Název školy: Gymnázium, Zábřeh, náměstí Osvobození 20. Číslo projektu:
Vzdělávací materiál vytvořený v projektu P VK Název školy: Gymnázium, Zábřeh, náměstí svobození 20 Číslo projektu: Název projektu: Číslo a název klíčové aktivity: CZ.1.07/1.5.00/34.0211 Zlepšení podmínek
VíceCHEMIE. Pracovní list č. 10 - žákovská verze Téma: Bílkoviny. Mgr. Lenka Horutová
www.projektsako.cz CHEMIE Pracovní list č. 10 - žákovská verze Téma: Bílkoviny Lektor: Mgr. Lenka Horutová Projekt: Student a konkurenceschopnost Reg. číslo: CZ.1.07/1.1.07/03.0075 Teorie: Název proteiny
VíceAminokyseliny, proteiny, enzymy Základy lékařské chemie a biochemie 2014/2015 Ing. Jarmila Krotká Metabolismus základní projev života látková přeměna souhrn veškerých dějů, které probíhají uvnitř organismu
VíceLodish et al, Molecular Cell Biology, 4-6 vydání Alberts et al, Molecular Biology of the Cell, 4 vydání
Lodish et al, Molecular Cell Biology, 4-6 vydání Alberts et al, Molecular Biology of the Cell, 4 vydání http://web.natur.cuni.cz/~zdenap/zdenateachingnf.html CHEMICKÉ SLOŽENÍ BUŇKY BUŇKA: 99 % C, H, N,
VíceBiopolymery. struktura syntéza
Biopolymery struktura syntéza Nukleové kyseliny Proteiny Polysacharidy Polyisopreny Ligniny.. Homopolymery Kopolymery (stat, alt, block, graft) Lineární Větvené Síťované kombinace proteiny Funkční úloha
VíceStruktura, chemické a biologické vlastnosti aminokyselin, peptidů a proteinů
Struktura, chemické a biologické vlastnosti aminokyselin, peptidů a proteinů Aminokyseliny CH COOH obsahují karboxylovou skupinu a aminovou skupinu nebarevné sloučeniny (Trp, Tyr, Phe absorbce v UV) základní
VíceBÍLKOVINY = PROTEINY Polymery aminokyselin propojených peptidovou vazbou
BÍLKOVINY = PROTEINY Polymery aminokyselin propojených peptidovou vazbou 20 AK 20 18 variant pro peptid složený z 20 AK!!! Průměrná bílkovina 300 AK Relativní molekulová hmotnost (bezrozměrné číslo) Molární
VíceAminokyseliny, Peptidy, Proteiny
Aminokyseliny, Peptidy, Proteiny Proteiny jsou nejrozšířenější biologické makromolekuly Proteiny jsou tvořeny kombinací 20 α-aminokyselin Aminokyseliny sdílejí společné základní strukturní vlastnosti α-uhlík
VíceV organismu se bílkoviny nedají nahradit žádnými jinými sloučeninami, jen jako zdroj energie je mohou nahradit sacharidy a lipidy.
BÍLKOVINY Bílkoviny jsou biomakromolekulární látky, které se skládají z velkého počtu aminokyselinových zbytků. Vytvářejí látkový základ života všech organismů. V tkáních vyšších organismů a člověka je
VíceAminokyseliny, struktura a vlastnosti bílkovin
Aminokyseliny, struktura a vlastnosti bílkovin doc. Jana Novotná Ústav lékařské chemie a klinické biochemie, 2. LF UK a FN Motol 2016 1. 20 aminokyselin, kódovány standardním genetickým kódem, proteinogenní,
VíceMetabolizmus aminokyselin II
Metabolizmus aminokyselin II Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 2.LF UK a FN Motol dr. Matej Kohutiar, doc. Jana Novotná matej.kohutiar@lfmotol.cuni.cz Praha 2017 Degradace uhlíkové kostry aminokyselin
VíceSTRUKTURA PROTEINŮ
projekt GML Brno Docens DUM č. 17 v sadě 22. Ch-1 Biochemie Autor: Martin Krejčí Datum: 03.05.2014 Ročník: 6AF, 6BF Anotace DUMu: Struktura proteinů Materiály jsou určeny pro bezplatné používání pro potřeby
VíceBiochemie dusíkatých látek při výrobě vína
Biochemie dusíkatých látek při výrobě vína Ing. Michal Kumšta www.zf.mendelu.cz Ústav vinohradnictví a vinařství kumsta@mendelu.cz Vzdělávací aktivita je součástí projektu CZ.1.07/2.4.00/31.0089 Projekt
VíceGenomické databáze. Shlukování proteinových sekvencí. Ivana Rudolfová. školitel: doc. Ing. Jaroslav Zendulka, CSc.
Genomické databáze Shlukování proteinových sekvencí Ivana Rudolfová školitel: doc. Ing. Jaroslav Zendulka, CSc. Obsah Proteiny Zdroje dat Predikce struktury proteinů Cíle disertační práce Vstupní data
VícePEPTIDY, BÍLKOVINY. Reg. č. projektu CZ.1.07/1.1.00/14.0143
PEPTIDY, BÍLKOVINY Definice: Bílkoviny (proteiny) jsou makromolekulární látky, které vznikají spojením sto a více molekul různých aminokyselin peptidickou vazbou. Obsahují atomy uhlíku (50 až 55%), vodíku
VíceMetabolismus aminokyselin - testík na procvičení - Vladimíra Kvasnicová
Metabolismus aminokyselin - testík na procvičení - Vladimíra Kvasnicová Vyberte esenciální aminokyseliny a) Asp, Glu b) Val, Leu, Ile c) Ala, Ser, Gly d) Phe, Trp Vyberte esenciální aminokyseliny a) Asp,
VíceMolekulární biofyzika
Molekulární biofyzika Molecules of life Centrální dogma membrány Metody GI a MB Biofyzika buňky Biofyzika tkání proteiny, nukleové kyseliny struktura, funkce replikace, transkripce, translace struktura,
VíceDUM č. 15 v sadě. 22. Ch-1 Biochemie
projekt GML Brno Docens DUM č. 15 v sadě 22. Ch-1 Biochemie Autor: Martin Krejčí Datum: 30.04.2014 Ročník: 6AF, 6BF Anotace DUMu: Rozdělení aminokyselin, chemické vzorce aminokyselin, amnokyseliny, významné
VíceEvropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti URČOVÁNÍ PRIMÁRNÍ STRUKTURY BÍLKOVIN
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti URČOVÁNÍ PRIMÁRNÍ STRUKTURY BÍLKOVIN Primární struktura primární struktura bílkoviny je dána pořadím AK jejích polypeptidových řetězců
VíceAminokyseliny R CH COO. R = postranní etzec
Aminokyseliny Z biologických systém bylo izolováno nkolik stovek aminokyselin. které jsou rozšíené obecn, jiné jsou jen v uritých druzích nebo dokonce jen v jednom organismu. ejdležitjších z nich je 20,
VíceInovace bakalářského studijního oboru Aplikovaná chemie http://aplchem.upol.cz
Inovace bakalářského studijního oboru Aplikovaná chemie http://aplchem.upol.cz Z.1.07/2.2.00/15.0247 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. Funkční
VíceBiofyzikální chemie nekovalentní interakce, prostorové uspořádání proteinů, voda. Zita Purkrtová říjen - prosinec 2015
Biofyzikální chemie nekovalentní interakce, prostorové uspořádání proteinů, voda Zita Purkrtová říjen - prosinec 2015 Interakce v biochemii D. L. Nelson, M.M. Cox: Lehninger Principles of Biochemistry,
VícePřírodní polymery. struktura syntéza
Přírodní polymery struktura syntéza Nukleové kyseliny Proteiny Polysacharidy Polyisopreny Ligniny.. průmyslové využití (tradiční, obnovitelný zdroj) Sruktura komplikovanější Homopolymery Kopolymery (stat?,
VíceBílkoviny. Bílkoviny. Bílkoviny Jsou
Bílkoviny Bílkoviny Úkol: Vyberte zdroje bílkovin: Citróny Tvrdý sýr Tvaroh Jablka Hovězí maso Luštěniny Med Obilí Vepřové sádlo Hroznové víno Bramborové hlízy Řepa cukrovka Bílkoviny Základními stavebními
VíceUrčení molekulové hmotnosti: ESI a nanoesi
Cvičení Určení molekulové hmotnosti: ESI a nanoesi ) 1)( ( ) ( H m z H m z M k j j j m z z zh M Molekula o hmotnosti M se nabije z-krát protonem, pík iontu ve spektru je na m z : ) ( H m z M z Pro dva
VíceVazebné interakce protein s DNA
Vazebné interakce protein s DNA Vazebné možnosti vn jší vazba atmosféra + iont kolem nabité DNA vazba ve žlábku van der Waalsovský kontakt s lé ivem ve žlábku interkalace vmeze ení planárního aromat.
VíceBiologie buňky. proteiny, nukleové kyseliny, procesy genom, architekura,funkce, mitoza, buněčná smrt, kmenové buňky, diferenciace
Biologie buňky Molecules of life Struktura buňky, Buněčný cyklus proteiny, nukleové kyseliny, procesy genom, architekura,funkce, mitoza, buněčná smrt, kmenové buňky, diferenciace Buněčná membrána mezibuněčné
VícePrvní testový úkol aminokyseliny a jejich vlastnosti
První testový úkol aminokyseliny a jejich vlastnosti Vysvětlete co znamená pojem α-aminokyselina Jaký je rozdíl mezi D a L řadou aminokyselin Kolik je základních stavebních aminokyselin a z čeho jsou odvozeny
VíceZákladní vlastnosti proteinů
RNA Ribosom Protein Protein Základní vlastnosti proteinů Teoretický úvod Aplikovaná bioinformatika, Jaro 2013 Proteiny RNA Ribosom Protein Protein Protein, polypeptid, bílkovina. Lineární polymer aminokyselin
VíceBiologie buňky. systém schopný udržovat se a rozmnožovat
Biologie buňky 1665 - Robert Hook (korek, cellulae = buňka) Cytologie - věda zabývající se studiem buňek Buňka ozákladní funkční a stavební jednotka živých organismů onejmenší známý uspořádaný dynamický
VíceOPVK CZ.1.07/2.2.00/
OPVK CZ.1.07/2.2.00/28.0184 Základní principy vývoje nových léčiv OCH/ZPVNL Mgr. Radim Nencka, Ph.D. ZS 2012/2013 Molekulární interakce SAR Možné interakce jednotlivých funkčních skupin 1. Interakce alkoholů
VíceBiochemický ústav LF MU (J.D.) 2008
Proteiny & Glykoproteiny Biochemický ústav LF MU (J.D.) 2008 1 Proteiny jsou polypeptidy (anhydropolymery L-AK) R H C α H α N C C C N H R C α hlavní řetězec H R H postranní řetězce mají identickou páteř:
VíceStruktura biomakromolekul
Struktura biomakromolekul ejvýznamnější biomolekuly proteiny nukleové kyseliny polysacharidy lipidy... měli bychom znát stavební kameny života Proteiny Aminokyseliny tvořeny aminokyselinami L-α-aminokyselinami
VíceProteiny: obecná charakteristika. Proteiny: trocha historie. Proteiny: trocha historie
Proteiny: obecná charakteristika Stojí na počátku vzniku života, jsou podstatou všech živých organizmů; zastávají životně důležité funkce, bez kterých by život nemohl existovat Kvantitativně (50-80% sušiny)
VíceBiochemie I. Aminokyseliny a peptidy
Biochemie I Aminokyseliny a peptidy Aminokyseliny a peptidy (vlastnosti, stanovení a reakce) AMINOKYSELINY Když se řekne AK ( -COOH, -NH 2 nebo -NH-) prostorový vztah aminoskupiny a karboxylové skupiny:
VíceAMINOKYSELINY REAKCE
CHEMIE POTRAVIN - cvičení AMINOKYSELINY REAKCE Milena Zachariášová (milena.zachariasova@vscht.cz) Ústav chemie a analýzy potravin, VŠCHT Praha REAKCE AMINOKYSELIN část 1 ELIMINAČNÍ REAKCE DEKARBOXYLACE
VíceMetabolismus aminokyselin 2. Vladimíra Kvasnicová
Metabolismus aminokyselin 2 Vladimíra Kvasnicová Odbourávání AMK 1) odstranění aminodusíku z molekuly AMK 2) detoxikace uvolněné aminoskupiny 3) metabolismus uhlíkaté kostry AMK 7 produktů 7 degradačních
VíceAminokyseliny a dlouhodobá parenterální výživa. Luboš Sobotka
Aminokyseliny a dlouhodobá parenterální výživa Luboš Sobotka Reakce na hladovění a stres jsou stejné asi 4000000 let Přežít hladovění a akutní stav Metody sledování kvality AK roztoků Vylučovací metoda
VíceEnzymové pexeso. L: lactose P: operon
Enzymové pexeso http://web.vscht.cz/~spiwokv/enzymologie/pexeso/ L: lactose P: operon Struktura proteinů: Primární: Struktura proteinů: Primární: Sekvenování: - sekvenováním (c)dna - hmotnostní spektrometrií
VíceTRANSLACE - SYNTÉZA BÍLKOVIN
TRANSLACE - SYNTÉZA BÍLKOVIN Translace - překlad genetické informace z jazyka nukleotidů do jazyka aminokyselin podle pravidel genetického kódu. Genetický kód - způsob zápisu genetické informace Kód Morseovy
VíceBiochemie I 2016/2017. Makromolekuly buňky. František Škanta
Biochemie I 2016/2017 Makromolekuly buňky František Škanta Makromolekuly buňky ukry Tuky Bílkoviny ukry Jsou sladké Přehled strukturních forem sacharidů Monosacharidy Disacharidy Polysacharidy Ketotriosa
Více5. Proteiny. Peptidy. Struktura proteinů. Primární struktura proteinů. Sekundární struktura proteinů
5. Proteiny Peptidy Peptidy jsou látky, které vznikají spojením aminokyselin peptidovými vazbami do řetězce. Peptidy rozdělujeme podle délky řetězce: ligopeptidy obsahují dvě až deset aminokyselin. Můžeme
VíceSložení a struktura základních biomolekul (nk,proteiny,sacharidy)
Složení a struktura základních biomolekul (nk,proteiny,sacharidy) 1 Proteiny Aminokyseliny Obrázek 1: Aminokyseliny Všechny bílkoviny, co jich na světě je, se skládají z 20 aminokyselin (AA) na Obrázku
VíceStruktura proteinů a funkce enzymů
Struktura proteinů a funkce enzymů RNDr. Tomáš Obšil, PhD. Katedra fyzikální a makromolekulární chemie Přírodovědecká fakulta UK v Praze HTobsil@natur.cuni.czTH 1. Struktura proteinů Proteiny se skládají
VíceTypy molekul, látek a jejich vazeb v organismech
Typy molekul, látek a jejich vazeb v organismech Typy molekul, látek a jejich vazeb v organismech Organismy se skládají z molekul rozličných látek Jednotlivé látky si organismus vytváří sám z jiných látek,
VíceSTANOVENÍ AMINOKYSELINOVÉHO SLOŽENÍ BÍLKOVIN. Postup stanovení aminokyselinového složení
STANVENÍ AMINKYSELINVÉH SLŽENÍ BÍLKVIN Důvody pro stanovení AK složení určení nutriční hodnoty potraviny, suroviny (esenciální vs. neesenciální AK) charakterizace určité bílkovinné frakce nebo konkrétní
VíceSkupenské stavy. Kapalina Částečně neuspořádané Volný pohyb částic nebo skupin částic Částice blíže u sebe
Skupenské stavy Plyn Zcela neuspořádané Hodně volného prostoru Zcela volný pohyb částic Částice daleko od sebe Kapalina Částečně neuspořádané Volný pohyb částic nebo skupin částic Částice blíže u sebe
VíceEnzymologie. Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 2.LF UK a FN Motol Matej Kohutiar. akad. rok 2017/2018
Enzymologie Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 2.LF UK a FN Motol Matej Kohutiar akad. rok 2017/2018 Osnova I. Základní principy enzymových reakcí II. Termodynamické a kinetické aspekty enzymové
VíceSešit pro laboratorní práci z chemie
Sešit pro laboratorní práci z chemie téma: Reakce aminokyselin a bílkovin autor: MVDr. Alexandra Gajová vytvořeno při realizaci projektu: Inovace školního vzdělávacího programu biologie a chemie registrační
VíceGymnázium Jiřího Ortena, Kutná Hora
Předmět: Náplň: Třída: Počet hodin: Pomůcky: Chemie (CHE) Organická chemie, biochemie 3. ročník a septima 2 hodiny týdně Školní tabule, interaktivní tabule, tyčinkové a kalotové modely molekul, zpětný
VíceStruktura nukleových kyselin Vlastnosti genetického materiálu
Struktura nukleových kyselin Vlastnosti genetického materiálu V předcházejících kapitolách bylo konstatováno, že geny jsou uloženy na chromozomech a kontrolují fenotypové vlastnosti a že chromozomy se
Více3.2. Metabolismus bílkovin, peptidů a aminokyselin
3.2. Metabolismus bílkovin, peptidů a aminokyselin Základní charakteristiky Bílkoviny (proteiny) jsou makromolekulární sloučeniny tvořené různě dlouhými polypeptidovými řetězci, které jsou složené z proteinogenních
VíceMetabolizmus aminokyselin I
Metabolizmus aminokyselin I Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 2.LF UK a FN Motol MUDr. Bc. Matej Kohutiar, Ph.D. matej.kohutiar@lfmotol.cuni.cz Praha 2018 snova I. přednáška: Metabolizmus a meziorgánové
VícePřístupy k analýze opticky aktivních látek metodou HPLC
Přístupy k analýze opticky aktivních látek metodou HPLC Karel Lemr Katedra analytické chemie, Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého tř. Svobody 8, 771 46 Olomouc lemr@prfnw.upol.cz Zentiva, Praha,
VíceOrganická chemie 3.ročník studijního oboru - kosmetické služby.
Organická chemie 3.ročník studijního oboru - kosmetické služby. T-7 Funkční a substituční deriváty karboxylových kyselin Zpracováno v rámci projektu Zlepšení podmínek ke vzdělávání Registrační číslo projektu:
VíceSubstituční deriváty karboxylových kyselin
Substituční deriváty karboxylových kyselin Vznikají substitucemi v, ke změnám v karboxylové funkční skupině. Poloha nové skupiny se často ve spojení s triviálními názvy označuje řeckými písmeny: Mají vlastnosti
VíceHemoglobin a jemu podobní... Studijní materiál. Jan Komárek
Hemoglobin a jemu podobní... Studijní materiál Jan Komárek Bioinformatika Bioinformatika je vědní disciplína, která se zabývá metodami pro shromážďování, analýzu a vizualizaci rozsáhlých souborů biologických
VíceChemická reaktivita NK.
Chemické vlastnosti, struktura a interakce nukleových kyselin Bi7015 Chemická reaktivita NK. Hydrolýza NK, redukce, oxidace, nukleofily, elektrofily, alkylační činidla. Mutageny, karcinogeny, protinádorově
VíceBIOSTIMULÁTOR AGRO-SORB ZDRAVÍ PRO POLE. VP AGRO, spol. s.r.o. Stehlíkova , Praha 6 - Suchdol
BIOSTIMULÁTOR AGRO-SORB ZDRAVÍ PRO POLE VP AGRO, spol. s.r.o. Stehlíkova 977 165 00, Praha 6 - Suchdol 18 volných aminokyselin (L- alfa) 18 volných aminokyselin (L- alfa) 18 volných aminokyselin (L- alfa)
VíceMolekulární biofyzika
Molekulární biofyzika Molecules of life Centrální dogma membrány Metody GI a MB Interakce proteiny, nukleové kyseliny struktura, funkce replikace, transkripce, translace struktura, funkce analýza proteinů,
VíceCysteinové adukty globinu jako potenciální biomarkery expozice styrenu
Cysteinové adukty globinu jako potenciální biomarkery expozice styrenu J. Mráz, I. Hanzlíková, Š. Dušková, E. Frantík, V. Stránský Státní zdravotní ústav Praha 1 Biomarkery expozice cizorodým látkám výchozí
VíceStruktura sacharidů a nukleových kyselin
Struktura sacharidů a nukleových kyselin Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 2. LF UK a F Motol Matej Kohutiar 2017 snova přednášky I.Struktura sacharidů 1. Monosacharidy Reakce sacharidů 2. ligosacharidy
VíceObecný metabolismus.
mezioborová integrace výuky zaměřená na rostlinnou biochemii a fytopatologii CZ.1.07/2.2.00/28.0171 becný metabolismus. Mechanismy enzymové katalýzy (7). Prof. RNDr. Pavel Peč, CSc. Katedra biochemie Přírodovědecká
VíceBÍLKOVINY = PROTEINY Polymery aminokyselin propojených peptidovou vazbou
BÍLKOVINY = PROTEINY Polymery aminokyselin propojených peptidovou vazbou 20 AK 20 18 variant pro peptid složený z 20 AK!!! Průměrná bílkovina 300 AK Relativní molekulová hmotnost (bezrozměrné číslo) Molární
VíceBarvení textilií IV. Doc. Ing. Michal Vik, Ph.D., Ing. Martina Viková, Ph.D.
Barvení textilií IV Doc. Ing. Michal Vik, Ph.D., Ing. Martina Viková, Ph.D. Barviva pro proteinová Kyselá vlákna: Kovokomplexní Reaktivní Obrázky převzaty z: http://www.azerbaijanrugs.com/arfp-processing_wool.htm
Vícestrukturní (součástmi buněčných struktur) metabolická (realizují b. metabolizmus) informační (jako signály či receptory signálů)
1 Bílkoviny - představují cca. ½ suché hmotnosti buňky - molekuly bílkovin se podílí na všech základních životních procesech - součástmi buněčných struktur (stavební f-ce) Funkce bílkovin: strukturní (součástmi
VíceStruktura biomakromolekul
Struktura biomakromolekul ejvýznamnější biomakromolekuly l proteiny l nukleové kyseliny l polysacharidy l lipidy... měli bychom znát stavební kameny života Biomolekuly l proteiny l A DA, RA l lipidy l
VíceStereochemie. Jan Hlaváč
Stereochemie Jan laváč Pravidla Zápočet Průběžný test: Opravný test: 2 x písemný test v semestru test č. 1 přednášky 1-4 test č. 2 přednášky 5-9 nutno celkově 60% bodů, přičemž každý test musí být splněn
VíceNázvosloví substitučních derivátů karboxylových kyselin
Názvosloví substitučních derivátů karboxylových kyselin Substituční deriváty karboxylových kyselin Substituční deriváty karboxylových kyselin jsou sloučeniny, které obsahují ve své molekule kromě karboxylové
VíceGenetický kód. Jakmile vznikne funkční mrna, informace v ní obsažená může být ihned použita pro syntézu proteinu.
Genetický kód Jakmile vznikne funkční, informace v ní obsažená může být ihned použita pro syntézu proteinu. Pravidla, kterými se řídí prostřednictvím přenos z nukleotidové sekvence DNA do aminokyselinové
Více